В Metal Gear Ac!d 2 Снейк снова бросает вызов алчным корпорациям, жаждущим власти над миром. Только теперь карты ложатся иначе: отчаявшиеся негодяи решили устранить главную помеху своим планам — самого Снейка. Из охотника главный герой превратился в жертву. Сразу две организации отправили наемных убийц по следу неутомимого воина. Его смерти желает коррумпированная военная верхушка и, что еще страшнее, секретная женская организация под кодовым именем «Венера». Как известно, женщина — самый коварный противник…